深化醫改三年任務已到結束時限，全面覆蓋基層醫療機構的基本藥物制度的實施，雖然在一定程度上降低藥價，老百姓得到了一定的實惠，但基本藥物制度的供應、招標以及數量都存在一些問題。
　　12月20日，衛生部部長陳竺在全國藥監工作會議上表示：“現在政府舉辦的基層醫療機構已經全面覆蓋了基本藥物制度，其他醫療機構也將逐步全面配備并優先使用基本藥物。下一步，國家基本藥物目錄要進一步擴大，能夠適應所有醫療機構用藥。”
　　陳竺表示，基本藥物制度建設是整個醫改的重要任務，也是基層醫改的關鍵環節。下一步，將以基本藥物制度為抓手，藥品質量全程監控為切入點，確保基本藥物質量可靠、價格合理、供應及時、安全有效。國務院常務會議強調，提高國家基本藥物生產供應能力，確保質量安全、公平可及。要加強基本藥物抽驗和招標、采購、使用質量管理，完善農村基本藥物供應網和監督網。特別要加強短缺藥品的供應保障。
　　同時他表示，對于未來基層醫療衛生機構的改革，特別是下一步公立醫院改革，基本藥物制度是公立醫院改革繞不過去的改革。
　　但是國家制定的307種基本藥物制度，不能滿足老百姓的需求已經凸顯出來，更何況要面對大型公立醫院的改革？
　　陳竺在會議上表示說，目前中國的藥品產能整體過剩，但也同時存在部分藥品短缺的問題，例如有的“孤兒藥”、生物制品、血液制品等。這是涉及我國藥品可及性的重大問題，直接關系到建立完善國家基本藥物制度等醫改重點任務的完成。
　　“擴大基本藥物目錄，列一張單子很簡單，但是對于列入其中的‘孤兒藥’、血液、生物制品等，都提出了極大的挑戰。比如血液制品，血漿都經常告急，這些藥品很緊缺，能不能保證供應，我很擔心。”
　　無論是血漿還是免疫球蛋白，都是用于救命的藥品，特別是重癥救治中，它們一旦斷檔，就會直接威脅到生命，陳竺表示，應當對基本藥物的某些品種、“孤兒藥”、某些血液制品和生物制品，實施國家統一定點生產、統一招標采購、統一配送、統一儲備，從根本上保證供應。
　　同時陳竺釋疑，“對關鍵藥品實行統一生產、統一招標和配送，建立國家的藥品儲備制度，只是在藥品方面提出了對于一些藥品的更集中的一些想法，不是計劃經濟的產物。”
　　另外，關于藥監體系的檢測能力，陳竺表示：“相對于美國FDA擁有的多達幾千人的技術隊伍，我國承擔藥品、生物制品等相關產品檢驗檢測的中國食品藥品鑒定研究院，只有不到一千人，而且在生物制品、醫療器械檢測能力上急需大幅提升。”在全國食品藥品監督管理工作會議上，陳竺在講話中直言不諱。
　　全國食品藥品的標準以及有效檢測問題，一直備受關注。陳竺表示，國務院常務會議已經確定，要提高國家藥品標準，同時健全檢驗檢測體系。加強國家級藥品檢驗機構建設，改善省、地（市）級機構實驗室條件，加強縣級機構快速檢驗能力建設。
　　近年來，醫藥科技日新月異，干細胞治療等新的醫療手段正從實驗室走向臨床。《國家藥品安全規劃》把“提高檢驗檢測能力”作為重要內容，下一步在投入方向上，不僅要考慮地方檢驗檢測能力提高，更要從軟硬件兩個方面加大對中檢院的投入。